MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 29351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	AGC	2	6	16	21	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
2	NC_017327	AAC	2	6	67	72	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539800
3	NC_017327	C	6	6	90	95	0 %	0 %	0 %	100 %	384539800
4	NC_017327	CG	3	6	99	104	0 %	0 %	50 %	50 %	384539800
5	NC_017327	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
6	NC_017327	GCC	2	6	181	186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
7	NC_017327	CGGC	2	8	219	226	0 %	0 %	50 %	50 %	384539800
8	NC_017327	GAA	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539800
9	NC_017327	CCG	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
10	NC_017327	GGC	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539800
11	NC_017327	TC	3	6	451	456	0 %	50 %	0 %	50 %	384539800
12	NC_017327	CGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
13	NC_017327	TCCCG	2	10	534	543	0 %	20 %	20 %	60 %	384539800
14	NC_017327	CAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
15	NC_017327	GCG	2	6	642	647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539800
16	NC_017327	CAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
17	NC_017327	TCG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
18	NC_017327	CCG	2	6	770	775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
19	NC_017327	TCA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
20	NC_017327	CCG	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
21	NC_017327	ATC	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
22	NC_017327	TGA	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539800
23	NC_017327	CTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539800
24	NC_017327	TCA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
25	NC_017327	TGC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
26	NC_017327	GA	3	6	1167	1172	50 %	0 %	50 %	0 %	384539800
27	NC_017327	TCT	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539801
28	NC_017327	CGTC	2	8	1292	1299	0 %	25 %	25 %	50 %	384539801
29	NC_017327	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539801
30	NC_017327	TCG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539801
31	NC_017327	GATC	2	8	1361	1368	25 %	25 %	25 %	25 %	384539801
32	NC_017327	GCCGGC	2	12	1531	1542	0 %	0 %	50 %	50 %	384539801
33	NC_017327	CTC	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539801
34	NC_017327	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539801
35	NC_017327	AGG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539801
36	NC_017327	CGC	2	6	1704	1709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539801
37	NC_017327	GCA	2	6	1773	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539801
38	NC_017327	CG	3	6	1783	1788	0 %	0 %	50 %	50 %	384539801
39	NC_017327	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539801
40	NC_017327	GATCT	2	10	2004	2013	20 %	40 %	20 %	20 %	384539801
41	NC_017327	CAA	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539801
42	NC_017327	GAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539802
43	NC_017327	GCG	2	6	2362	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539802
44	NC_017327	TTG	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539802
45	NC_017327	GTCG	2	8	2428	2435	0 %	25 %	50 %	25 %	384539802
46	NC_017327	TCGC	2	8	2452	2459	0 %	25 %	25 %	50 %	384539802
47	NC_017327	GA	3	6	2553	2558	50 %	0 %	50 %	0 %	384539802
48	NC_017327	GTC	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
49	NC_017327	GCC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539802
50	NC_017327	TCG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
51	NC_017327	TCGC	2	8	2667	2674	0 %	25 %	25 %	50 %	384539802
52	NC_017327	TCGC	2	8	2747	2754	0 %	25 %	25 %	50 %	384539802
53	NC_017327	GATCG	2	10	2810	2819	20 %	20 %	40 %	20 %	384539802
54	NC_017327	GTG	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539802
55	NC_017327	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539802
56	NC_017327	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384539802
57	NC_017327	CGGTG	2	10	3253	3262	0 %	20 %	60 %	20 %	384539802
58	NC_017327	AGG	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539802
59	NC_017327	AGGGC	2	10	3398	3407	20 %	0 %	60 %	20 %	384539802
60	NC_017327	CTG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
61	NC_017327	G	6	6	3522	3527	0 %	0 %	100 %	0 %	384539802
62	NC_017327	TGT	2	6	3528	3533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539802
63	NC_017327	TGA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539803
64	NC_017327	CGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539803
65	NC_017327	CGC	2	6	3941	3946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539803
66	NC_017327	AGC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539803
67	NC_017327	CGC	2	6	3987	3992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539803
68	NC_017327	GGC	2	6	4105	4110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539803
69	NC_017327	T	6	6	4111	4116	0 %	100 %	0 %	0 %	384539803
70	NC_017327	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
71	NC_017327	CGG	2	6	4657	4662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
72	NC_017327	GCA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539804
73	NC_017327	CGG	2	6	4756	4761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
74	NC_017327	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384539804
75	NC_017327	GCT	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539804
76	NC_017327	GCCT	2	8	4926	4933	0 %	25 %	25 %	50 %	384539804
77	NC_017327	GT	3	6	4956	4961	0 %	50 %	50 %	0 %	384539804
78	NC_017327	AGA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539804
79	NC_017327	CCG	2	6	5091	5096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539804
80	NC_017327	GCCG	2	8	5131	5138	0 %	0 %	50 %	50 %	384539804
81	NC_017327	CT	3	6	5243	5248	0 %	50 %	0 %	50 %	384539805
82	NC_017327	CT	3	6	5252	5257	0 %	50 %	0 %	50 %	384539805
83	NC_017327	G	6	6	5275	5280	0 %	0 %	100 %	0 %	384539805
84	NC_017327	GAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
85	NC_017327	TCC	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
86	NC_017327	GC	3	6	5514	5519	0 %	0 %	50 %	50 %	384539805
87	NC_017327	GAA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
88	NC_017327	GCGG	2	8	5616	5623	0 %	0 %	75 %	25 %	384539805
89	NC_017327	AGC	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
90	NC_017327	CGG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
91	NC_017327	TCC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
92	NC_017327	CGA	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
93	NC_017327	CAA	2	6	5724	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539805
94	NC_017327	CTT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539805
95	NC_017327	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
96	NC_017327	TCGG	2	8	5851	5858	0 %	25 %	50 %	25 %	384539805
97	NC_017327	CGG	2	6	5871	5876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
98	NC_017327	GGC	2	6	5895	5900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
99	NC_017327	GCG	2	6	5920	5925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
100	NC_017327	CAA	2	6	5926	5931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539805
101	NC_017327	AGA	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
102	NC_017327	CCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539805
103	NC_017327	GAA	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
104	NC_017327	GC	3	6	6126	6131	0 %	0 %	50 %	50 %	384539805
105	NC_017327	TGC	2	6	6176	6181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
106	NC_017327	GCCG	2	8	6220	6227	0 %	0 %	50 %	50 %	384539805
107	NC_017327	CGG	2	6	6254	6259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
108	NC_017327	CCCG	2	8	6268	6275	0 %	0 %	25 %	75 %	384539805
109	NC_017327	GGGC	2	8	6344	6351	0 %	0 %	75 %	25 %	384539805
110	NC_017327	TCT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539805
111	NC_017327	TC	3	6	6425	6430	0 %	50 %	0 %	50 %	384539805
112	NC_017327	GCG	2	6	6461	6466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
113	NC_017327	GGC	2	6	6525	6530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
114	NC_017327	CG	3	6	6550	6555	0 %	0 %	50 %	50 %	384539805
115	NC_017327	GCG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
116	NC_017327	TGC	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
117	NC_017327	GC	3	6	6603	6608	0 %	0 %	50 %	50 %	384539805
118	NC_017327	CGG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
119	NC_017327	GCT	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
120	NC_017327	CGA	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
121	NC_017327	ACCA	2	8	6670	6677	50 %	0 %	0 %	50 %	384539805
122	NC_017327	GCT	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
123	NC_017327	TCG	3	9	6737	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
124	NC_017327	ACG	2	6	6752	6757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
125	NC_017327	CCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
126	NC_017327	GATC	2	8	7143	7150	25 %	25 %	25 %	25 %	384539806
127	NC_017327	GCT	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
128	NC_017327	CGTG	2	8	7199	7206	0 %	25 %	50 %	25 %	384539806
129	NC_017327	CGG	2	6	7251	7256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539806
130	NC_017327	CCG	2	6	7281	7286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539806
131	NC_017327	CAG	2	6	7302	7307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
132	NC_017327	ACCGG	2	10	7313	7322	20 %	0 %	40 %	40 %	384539806
133	NC_017327	TCGA	2	8	7332	7339	25 %	25 %	25 %	25 %	384539806
134	NC_017327	ACG	2	6	7374	7379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
135	NC_017327	CGC	2	6	7390	7395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539806
136	NC_017327	TCG	2	6	7413	7418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
137	NC_017327	CGA	2	6	7438	7443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
138	NC_017327	CAG	3	9	7541	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
139	NC_017327	GCCG	2	8	7559	7566	0 %	0 %	50 %	50 %	384539806
140	NC_017327	CAT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539806
141	NC_017327	GTC	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
142	NC_017327	GAGG	2	8	7694	7701	25 %	0 %	75 %	0 %	384539806
143	NC_017327	CGA	2	6	7954	7959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
144	NC_017327	ACC	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539806
145	NC_017327	TCA	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539806
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147	NC_017327	ACG	3	9	8238	8246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539807
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151	NC_017327	CCGG	2	8	8290	8297	0 %	0 %	50 %	50 %	384539807
152	NC_017327	GCTTG	2	10	8337	8346	0 %	40 %	40 %	20 %	384539807
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156	NC_017327	GTGCG	2	10	8791	8800	0 %	20 %	60 %	20 %	384539808
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160	NC_017327	GCGATC	2	12	8906	8917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384539808
161	NC_017327	CTT	2	6	8919	8924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539808
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164	NC_017327	CCT	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539808
165	NC_017327	TCG	2	6	9224	9229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
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255	NC_017327	GAT	2	6	13999	14004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539812
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259	NC_017327	CAGA	2	8	14337	14344	50 %	0 %	25 %	25 %	384539812
260	NC_017327	GACCA	2	10	14372	14381	40 %	0 %	20 %	40 %	384539812
261	NC_017327	CCG	2	6	14489	14494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539812
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263	NC_017327	AGTC	2	8	14532	14539	25 %	25 %	25 %	25 %	384539812
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